Autorem książki Czarna skrzynka Darwina. Biochemiczne wyzwanie dla ewolucjonizmu jest Michael J. Behe, amerykański biochemik.Pierwsze, anglojęzyczne wydanie ukazało się w 1996 roku nakładem wydawnictwa Free Press.Już we wstępie autor podkreśla, iż literatura naukowa mieści mnóstwo opisów tego, jak coś funkcjonuje (np. Układ Słoneczny). Amerykańskiego uczonego interesuje jednak pochodzenia tego, co już istnieje. Behe kieruje swoją uwagę na świat przyrody ożywionej w mikroskali i zastanawia się, czy życie na poziomie molekularnym, czyli jak pisze fundament życia, może zostać wyjaśnione na podstawie losowych mutacji i doboru naturalnego.Autor prezentowanej publikacji argumentuje, iż niektóre układy biologiczne zwane poprzez niego mechanizmami molekularnymi posiadają pewną cechę, która nie może zostać wyjaśniona naturalistycznie. Behe ma na myśli nieredukowalną złożoność. Zgodnie z tym ujęciem, układ nieredukowalnie złożony składa się z wielu wzajemnie dostosowanych części, które pełnią określoną funkcję. Usunięcie chociażby jednego elementu powoduje, iż układ przestaje być użyteczny. Uczony twierdzi, że układy tego typu nie mogły powstać na gruncie darwinowskiej ewolucji kumulatywnej postępującej minimalnymi krokami, lecz są świadectwem inteligentnego projektu. Amerykański biochemik omawia w tym kontekście pomiędzy innymi przykład wici bakteryjnej, która składa się z około 50 różnorodnych typów białek i służy bakteriom jako swego rodzaju silnik obrotowy. Nie mogła ona, jak argumentuje Behe, powstać drogą stopniowych przekształceń, ponieważ na wcześniejszych etapach nie pełniłaby swojej funkcji. By zobrazować swój pogląd, uczony posłużył się przykładem struktury nieredukowalnie złożonej używanej w życiu rutynowym. Mianowicie typowa pułapka na myszy musi od razu mieć wszystkie elementy w odpowiednim ułożeniu, ponieważ w innym przypadku nie pełniłaby określonej funkcji polegającej na łapaniu myszy.Warto zaznaczyć, że Behe jest ewolucjonistą, ale niedarwinowskim. Akceptuje on pogląd o wspólnocie pochodzenia, ale odrzuca twierdzenie o przypadkowych mutacjach mogących doprowadzić do powstania złożonych struktur biologicznych. Książka Czarna skrzynka Darwina posiada pozytywną argumentację na rzecz teorii inteligentnego projektu.