Miłość do koni bywa lekiem. Przekonała się o tym grupa dzieci spędzająca wakacje na wsi w ośrodku hipoterapii. Między podopiecznymi a zwierzętami formuje się silna więź. Nad wyraz ważny staje się tytułowy koń na receptę, Szogun, którego chce odebrać stadninie jego właścicielka. Dzieci szukają rozwiązania. Rozbijają swoje skarbonki, zbierają w lesie jagody i grzyby. Piszą na dodatek wiersze o koniach, malują do nich ilustracje i próbują sprzedać swoje dzieła turystom. Czy ich wysiłki okażą się efektywne, a zarobione pieniądze wystarczą na wykupienie Szoguna, żeby mógł nadal służyć ich niepełnosprawnym kolegom?
Koń na receptę to poruszająca opowieść o znacznej sile przyjaźni, radzeniu sobie z przeciwnościami losu i satysfakcji ze wspólnego działania. Jednak przeważnie to historia o miłości między człowiekiem a zwierzęciem. Miłości, która niesie uzdrowienie.